PyMOLでリボンモデルをRibbons風に表示する方法

PyMOLで、タンパク質や核酸のリボンモデルをRibbons風に表示するスクリプトを書きました。興味のある方はこちらからダウンロードしてください。PyMOLを立ち上げて分子を表示し、メニューバーから Display > Background > White を選択して背景を白色にします。あとは、File > Run… を選択してスクリプトを読み込めば Ribbonsソフトウエアで表示されるようなリボンモデルが表示されるはずです。

ray 1000,1000

でレンダリングした例を下に示します。

PyMOLデフォルトの表示

PDBID: 1Q3L  PyMOLデフォルトの表示

Ribbons風の表示

PDBID: 1Q3L  Ribbons風の表示

Ribbonsでの表示とまったく同じではありませんが、かなり近い感じではあると思います。参考までにいくつか例を示します。

PDBID: 3AFA  nucleosome core particle

PDBID: 1KN0  DNA repair protein RAD52